Nat Genet： 人类癌症中病原分布

德国胰脏症数据分析中心 Peter Lichter 他的团队最新数据分析探寻了生命体胰脏症中菌株的属。月底《自然—遗传学》应用软件发表了这一实质性。

作为泛胰脏正因如此DNA分析Union的一部分，该数据库系统抽取了 38 个类型的 2658 例胰脏症试样的正因如此DNA和一部分激活正因如此DNA测序数据，数据分析人员来进行共识的方法，构建了 3 个独立数据库系统用以系统地数据分析潜在的菌株微生物。在 382 个DNA和 68 个激活组数据集中都探测到了菌株不存在。数据分析发掘出，已知的与相关的菌株，如密友—巴尔菌株（EBV）、流感病毒菌株（HBV）和人瘤菌株（HPV）的检出率都很高。

这项数据分析概述了头颈胰脏中 HPV 和驱动基因甲基化的在在政治性以及 HPV 与 APOBEC 甲基化特征的相关性，这指出抗菌株防御能力增高是宫颈胰脏、结核病和头颈胰脏的诱因。对于 HBV、HPV16、HPV18 和腺相关菌株 2，菌株构建与DNA拷贝数的全局变化有关。在 TERT 启动子处的构建与原核的高表达有关，从而明显激活了该的发育过程。内源性逆激活菌株的高表达与肾胰脏患者较差的生存期有关。

原始中有：

Zapatka， M.， Borozan， I.， Brewer， D.S. et al. The landscape of viral associations in human cancers. Nat Genet (2020). https：//doi.org/10.1038/s41588-019-0558-9.